穿行測試就是追蹤交易在財務報告信息系統中的處理過程。這是注冊會計師了解被審計單位業務流程及其相關控制時經常使用的審計程序。通過追蹤某筆或某幾筆交易在業務流程中如何生成、記錄、處理和報告，以及相關內部控制如何執行，注冊會計師可以確定被審計單位的交易流程和相關控制是否與之前通過其他程序所獲得的了解一致，并確定相關控制是否得到執行。比如我們對于某一筆銷售業務進行穿行測試，追查其從接受訂單到批準銷售，再到發貨與開具賬單，再到賬簿記錄與收回款項，來了解被審計單位這一系列環節中如何設計、實施了相關的內部控制。穿行測試的意思就是在被審單位已經留下了審計軌跡的內控再進行檢查，而不是對其已經設計好的內部控制重新執行一遍。
重新執行和穿行測試的區別：首先，穿行測試是為了獲得有關控制和執行的審計證據，但是測試的數量較少，一般不能提供充分適當的審計證據。其次，根據穿行測試的定義，即追蹤交易在財務信息系統中的記錄過程。重新執行是一種獲取審計證據的方法，在控制測試的時候可以使用，根據定義，是由注冊會計師重新獨立執行，也就是說，不是檢查已有的憑證或記錄，而是會產生新的證據，當然可靠性就會高一些。穿行測試也可以在控制測試中運用，如果在控制測試中運用的話，則和重新執行同屬于控制測試的內容了。
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