新疆二級建造師證書領取后，在三年以內都可以申請初始注冊。
如果在這三年以內沒有申請初始注冊，之后再申請初始注冊的話就需要滿足繼續教育條件。二級建造師注冊的有效期只有三年，因此初始注冊之后，三年有效期滿就需要申請延續注冊，若注冊到期沒有申請延續注冊，但還需要繼續執業的話，則可以申請證書重新注冊。
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新疆二級建造師注冊的具體時間和流程如下：
初始注冊時間：自資格證書核發之日起三年以內。
延續注冊時間：注冊有效期滿30日前。
重新注冊時間：重新符合二級建造師注冊條件后，并滿足繼續教育條件就可以申請重新注冊。
二級建造師注冊需要提交一定的材料，如注冊建造師初始注冊申請表等。注冊流程通常包括網上申請和提交紙質材料兩個步驟，具體流程可能因地區而異，建議考生在申請前仔細了解新疆當地的相關政策和要求。
此外，二級建造師受聘于一個具備相關資質的單位也是注冊的必要條件之一，單位資質要求為建設工程勘察、設計、施工、監理、招標代理、造價咨詢等。
