執業藥師實行注冊制度。國家藥監局負責執業藥師注冊的政策制定和組織實施，指導全國執業藥師注冊管理工作。各省、自治區、直轄市藥品監督管理部門負責本行政區域內的執業藥師注冊管理工作。
取得《執業藥師職業資格證書》者，應當通過全國執業藥師注冊管理信息系統向所在地注冊管理機構申請注冊。經注冊后，方可從事相應的執業活動。未經注冊者，不得以執業藥師身份執業。
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