為貫徹落實《行政許可法》提出的轉變政府管理模式，建設公正透明、廉潔勤政、高效便民的政府，實行政務公開、陽光審批，提高行政效能和政府公信力的要求，國家食品藥品監督管理部門于2008年1月運行執業藥師注冊管理網絡信息系統，實現執業藥師注冊行政許可項目的網上申報、網上審批、網上公告、網上監督。
執業藥師注冊網上申報辦理程序是：執業藥師登錄國家食品藥品監督管理總局執業藥師注冊網絡服務平臺(網址：http://link.233.com/12169/zyysweb/index.jsp)
網上填寫個人基本信息-->網上修改登錄密碼-->網上填寫申報表-->網上提交申報-->網上打印申報表-->攜帶審核材料到執業單位所在地注冊機構進行審核-->網上查詢審核狀態-->網上注冊許可公告-->到注冊機構領取證書。
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