水利監理工程師在水利部政務平臺注冊。水利部實施水利監理工程師注冊，并對全國水利監理工程師的執業活動實施監督管理。
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符合注冊條件的人員本人須在水利部政務服務平臺進行注冊，填報申請材料，對材料的真實性、有效性承諾并負責。水利部收到申請材料后，對申請材料不齊全或不符合形式要求的，在5個工作日內一次性告知申請人需要補正的全部內容;逾期不告知的，自收到申請材料之日起即為受理。申請材料齊全、符合形式要求的，水利部自受理之日起15個工作日內予以注冊并核發水利監理工程師注冊證書。
水利監理工程師注冊申請條件
(一)取得職業資格證書;
(二)受聘于一家水利工程建設監理單位或者水利水電工程勘察、設計、施工、招標代理、造價咨詢、項目管理單位;
(三)符合本辦法第四章關于繼續教育的要求;
(四)無本辦法第十五條規定的不予注冊情形。
水利監理工程師繼續教育要求
水利監理工程師繼續教育每年應不少于30學時。取得職業資格證書超出1年期限申請初始注冊的人員，申請當年繼續教育應不少于30學時。被注銷注冊后重新申請注冊的人員，自被注銷注冊當年至重新申請注冊當年，繼續教育平均每年應不少于30學時，或近三年累計不少于90學時。
水利監理工程師不予注冊情形
有下列情形之一的，不予注冊：
(一)不具有完全民事行為能力的;
(二)申請在兩個或者兩個以上單位注冊的;
(三)年齡在70周歲以上的;
(四)受刑事處罰且尚未執行完畢的;
(五)隱瞞有關情況或者提供虛假材料申請注冊被警告，自處罰決定之日起至申請注冊之日止未滿1年的;
(六)存在第十八條第(一)(二)或(三)項情形被吊銷注冊證書，自處罰決定之日起至申請注冊之日止未滿2年的;
(七)以欺騙、賄賂等不正當手段獲得注冊被撤銷，自被撤銷注冊之日起至申請注冊之日止未滿3年的;
(八)存在第十八條第(四)或(五)項情形被吊銷注冊證書，自處罰決定之日起至申請注冊之日止未滿5年的;情節特別惡劣或因過錯造成重大以上安全事故的，終身不予注冊;
(九)法律、法規規定不予注冊的其他情形。
水利監理工程師注冊有效期
水利監理工程師注冊分為初始注冊、延續注冊、變更注冊及注銷注冊。
1、初始注冊的有效期為4年。
2、注冊有效期屆滿需繼續執業的，應當在有效期屆滿30日前申請延續注冊。延續注冊的有效期為4年。
3、水利監理工程師在注冊有效期內需要變更注冊專業的，應當申請變更注冊;需要變更執業單位或者執業單位名稱發生變更的，應當自與現聘用單位簽訂勞動合同(或勞務合同)或執業單位名稱變更之日起30日內申請變更注冊。變更注冊后，原注冊有效期屆滿時間不變。
