監理工程師可以注冊在建設工程勘察、設計、施工、監理、招標代理、造價咨詢等單位。
取得資格證書并受聘于一個建設工程勘察、設計、施工、監理、招標代理、造價咨詢等單位的人員，應當通過聘用單位向單位工商注冊所在地的省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門提出注冊申請;省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門受理后提出初審意見，并將初審意見和全部申報材料報國務院建設主管部門審批;符合條件的，由國務院建設主管部門核發注冊證書和執業印章。
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監理工程師專業注冊分類
監理工程師報名是分土木建筑工程專業、交通運輸工程專業和水利工程專業。取得資格證書后，每人可根據報名專業選擇對應專業注冊，每人最多可以申請兩個專業注冊。
| 報名專業 | 可注冊專業 | 主管部門 |
| 土木建筑工程 | 房屋建筑工程、冶煉工程、礦山工程、化工石油工程、水利水電工程、電力工程、農林工程、鐵路工程、公路工程、港口與航道工程、航天航空工程、通信工程、市政公用工程、機電安裝工程。 | 住房和城鄉保障部 |
交通運輸工程 （公路工程/水運工程） | 選擇注冊公路工程專業類別的，可以從道路與橋梁、隧道工程、公路機電工程3個注冊專業中，選擇注冊2個專業； 選擇注冊水運工程專業類別的，可以從港口工程、航道工程、水運機電工程3個注冊專業中，選擇注冊2個專業。 | 交通運輸部 |
| 水利工程 | 水利工程施工監理、水土保持工程施工監理、機電及金屬結構設備制造監理、水利工程建設環境保護監理四個專業。 | 水利部 |
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