注冊監理工程師依據其所學專業、工作經歷、工程業績，按照《工程監理企業資質管理規定》劃分的工程類別，按專業注冊。每人最多可以申請兩個專業注冊。
取得資格證書的人員申請注冊，由省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門初審，國務院建設主管部門審批。
取得資格證書并受聘于一個建設工程勘察、設計、施工、監理、招標代理、造價咨詢等單位的人員，應當通過聘用單位向單位工商注冊所在地的省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門提出注冊申請；省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門受理后提出初審意見，并將初審意見和全部申報材料報國務院建設主管部門審批；符合條件的，由國務院建設主管部門核發注冊證書和執業印章。
省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門在收到申請人的申請材料后，應當即時作出是否受理的決定，并向申請人出具書面憑證；申請材料不齊全或者不符合法定形式的，應當在5日內一次性告知申請人需要補正的全部內容。逾期不告知的，自收到申請材料之日起即為受理。
對申請初始注冊的，省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門應當自受理申請之日起20日內審查完畢，并將申請材料和初審意見報國務院建設主管部門。國務院建設主管部門自收到省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門上報材料之日起，應當在20日內審批完畢并作出書面決定，并自作出決定之日起10日內，在公眾媒體上公告審批結果。
對申請變更注冊、延續注冊的，省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門應當自受理申請之日起5日內審查完畢，并將申請材料和初審意見報國務院建設主管部門。國務院建設主管部門自收到省、自治區、直轄市人民政府建設主管部門上報材料之日起，應當在10日內審批完畢并作出書面決定。
對不予批準的，應當說明理由，并告知申請人享有依法申請行政復議或者提起行政訴訟的權利。
注冊證書和執業印章是注冊監理工程師的執業憑證，由注冊監理工程師本人保管、使用。
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