與其他合同的訂立程序相同，建設工程合同的訂立也要采取要約和承諾方式。根據《招標投標法》對招標、投標的規定，招標、投標、中標的過程實質就是要約、承諾的一種具體方式。招標人通過媒體發布招標公告，或向符合條件的投標人發出招標邀請，為要約邀請;投標人根據招標文件內容在約定的期限內向招標人提交投標文件，為要約;招標人通過評標確定中標人，發出中標通知書，為承諾;招標人和中標人按照中標通知書、招標文件和中標人的投標文件等訂立書面合同時，合同成立并生效。
建設工程施工合同的訂立往往要經歷二個較長的過程。在明確中標人并發出中標通知書后，雙方即可就建設工程施工合同的具體內容和有關條款展開談判，直到最終簽訂合同。
一、建設工程施工承包合同談判的主要內容
(一)關于工程內容和范圍的確認
招標人和中標人可就招標文件中的某些具體工作內容進行討論、修改、明確或細化，從而確定工程承包的具體內容和范圍。在談判中雙方達成一致的內容，包括在談判討論中經雙方確認的工程內容和范圍方面的修改或調整，應以文字方式確定下來，并以“合同補遺”或“會議紀要”方式作為合同附件，并明確它是構成合同的一部分。
對于為監理工程師提供的建筑物、家具、車輛以及各項服務，也應逐項詳細地予以明確。
(二)關于技術要求、技術規范和施工技術方案
雙方尚可對技術要求、技術規范和施工技術方案等進行進一步討論和確認，必要的情況下甚至可以變更技術要求和施工方案。
(三)關于合同價格條款
依據計價方式的不同，建設工程施工合同可以分為總價合同、單價合同和成本加酬金合同。一般在招標文件中就會明確規定合同將采用什么計價方式，在合同談判階段往往沒有討論的余地。但在可能的情況下，中標人在談判過程中仍然可以提出降低風險的改進方案。
(四)關于價格調整條款
對于工期較長的建設工程，容易遭受貨幣貶值或通貨膨脹等因素的影響，可能給承包人造成較大損失。價格調整條款可以比較公正地解決這一承包人無法控制的風險損失。
無論是單價合同還是總價合同，都可以確定價格調整條款，即是否調整以及如何調整等。可以說，合同計價方式以及價格調整方式共同確定了工程承包合同的實際價格，直接影響著承包人的經濟利益。在建設工程實踐中，由于各種原因導致費用增加的幾率遠遠大于費用減少的幾率，有時最終的合同價格調整金額會很大，遠遠超過原定的合同總價，因此承包人在投標過程中，尤其是在合同談判階段務必對合同的價格調整條款予以充分的重視。
(五)關于合同款支付方式的條款
建設工程施工合同的付款分四個階段進行，即預付款、工程進度款、最終付款和退還
保留金。關于支付時間、支付方式、支付條件和支付審批程序等有很多種可能的選擇，并且可能對承包人的成本、進度等產生比較大的影響，因此，合同支付方式的有關條款是談判的重要方面。
(六)關于工期和維修期
中標人與招標人可根據招標文件中要求的工期，或者根據投標人在投標文件中承諾的工期，并考慮工程范圍和工程量的變動而產生的影響來商定一個確定的工期。同時，還要明確開工日期、竣工日期等。雙方可根據各自的項目準備情況、季節和施工環境因素等條件洽商適當的開工時間。
對于具有較多的單項工程的建設工程項目，可在合同中明確允許分部位或分批提交業主驗收(例如成批的房屋建筑工程應允許分棟驗收;分多段的公路維修工程應允許分段驗收;分多片的大型灌溉工程應允許分片驗收等)，并從該批驗收時起開始計算該部分的維修期，以縮短承包人的責任期限，最大限度保障自己的利益。
雙方應通過談判明確，由于工程變更(業主在工程實施中增減工程或改變設計等)、惡劣的氣候影響，以及種種“作為一個有經驗的承包人無法預料的工程施工條件的變化”等原因對工期產生不利影響時的解決辦法，通常在上述情況下應該給予承包人要求合理延長工期的權利。
合同文本中應當對維修工程的范圍、維修責任及維修期的開始和結束時間有明確的規定，承包人應該只承擔由于材料和施工方法及操作工藝等不符合合同規定而產生的缺陷。
承包人應力爭以維修保函來代替業主扣留的保留金。與保留金相比，維修保函對承包人有利，主要是因為可提前取回被扣留的現金，而且保函是有時效的，期滿將自動作廢。同時，它對業主并無風險，真正發生維修費用，業主可憑保函向銀行索回款項。因此，這一做法是比較公平的。維修期滿后，承包人應及時從業主處撤回保函。
(七)合同條件中其他特殊條款的完善
主要包括：關于合同圖紙;關于違約罰金和工期提前獎金;工程量驗收以及銜接工序和隱蔽工程施工的驗收程序;關于施工占地;關于向承包人移交施工現場和基礎資料;關于工程交付;預付款保函的自動減額條款;等等。
三、建設工程施工承包合同最后文本的確定和合同簽訂
(一)合同風險評估
在簽訂合同之前，承包人應對合同的合法性、完備性、合同雙方的責任、權益以及合同風險進行評審、認定和評價。
(二)合同文件內容
建設工程施工承包合同文件構成：合同協議書;工程量及價格;合同條件，包括合同一般條件和合同特殊條件;投標文件;合同技術條件(含圖紙);中標通知書;雙方代表共同簽署的合同補遺(有時也以合同談判會議紀要形式);招標文件;其他雙方認為應該作為合同組成部分的文件，如：投標階段業主要求投標人澄清問題的函件和承包人所做的文字答復，雙方往來函件等。
對所有在招標投標及談判前后各方發出的文件、文字說明、解釋性資料進行清理。對凡是與上述合同構成內容有矛盾的文件，應宣布作廢。可以在雙方簽署的《合同補遺》中，對此作出排除性質的聲明。
(三)關于合同協議的補遺
在合同談判階段雙方談判的結果一般以《合同補遺》的形式，有時也可以以《合同談判紀要》形式，形成書面文件。
同時應該注意的是，建設工程施工承包合同必須遵守法律。對于違反法律的條款，即使由合同雙方達成協議并簽了字，也不受法律保障。
(四)簽訂合同
雙方在合同談判結束后，應按上述內容和形式形成一個完整的合同文本草案，經雙方代表認可后形成正式文件。雙方核對無誤后，由雙方代表草簽，至此合同談判階段即告結束。此時，承包人應及時準備和遞交履約保函，準備正式簽署施工承包合同。
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