參考答案：
1.在招標投標過程中的不妥之處和理由如下：
(1)不妥之處：開標時，由招標人檢查投標文件的密封情況。理由：《招標投標法》規定，開標時，由投標人或者其推選的代表檢查投標文件的密封情況，也可以由招標人委托的公證機構檢查并公證。
(2)不妥之處：評標委員會由招標人確定。理由：一般招標項目的評標委員會采取隨機抽取方式。該項目屬一般招標項目。
(3)不妥之處：評標委員會的組成不妥。理由：根據《招標投標法》規定，評標委員會由招標人的代表和有關技術、經濟等方面的專家組成，成員人數為5人以上單數，其中技術經濟等方面的專家不得少于成員總數的2/3.
2.B單位向招標人遞交的書面說明有效。根據《招標投標法》的規定，投標人在招標文件要求提交投標文件的截止時間前，可以補充、修改或者撤回已提交的投標文件，補充、修改的內容作為投標文件的組成部分。
3.在開標后，招標人應對C單位的投標書作廢標處理：因為C單位因投標書只有單位公章未有法定代表人印章或簽字，不符合招標投標法的要求。
4.投標書在下列情況下，可作廢標處理。①逾期送達的或者未送達指定地點的;②未按招標文件要求密封的;③無單位蓋章并無法定代表人簽字或蓋章的;④未按規定格式填寫，內容不全或關鍵字跡模糊、無法辨認的;⑤投標人遞交兩份或多份內容不同的投標文件，或在一份投標文件中對同一招標項目報有兩個或多個報價，且未聲明哪一個有效(按招標文件規定提交備選投標方案的除外);⑥投標人名稱或組織機構與資格預審時不一致的;⑦未按招標文件要求提交投標保證金的;⑧聯合體投標未附聯合體各方共同投標協議的。
5.招標對E單位的投標書作廢標的處理是正確的。因為E單位未能在投標截止時間前送達投標文件。
