（一）按費率計費

這種方法是按照工程規模大小和所委托的咨詢工作繁簡，以建設投資的一定百分比來計算。一般情況下，工程規模越大，建設投資越多，計算咨詢費的百分比越小。這種方法比較簡便、科學，頗受業主和咨詢單位歡迎，也是行業中工程咨詢釆用的計費方式之一。

（二）按人工時計費

這種方法是根據合同項目執行時間（時間單位可以是小時，也可以是工作日或月），以補償費加一定數額的補貼來計算咨詢費總額。單位時間的補償費用一般以咨詢企業職員的基本工資為基礎，再加上一定的管理費和利潤（稅前利潤）。采用這種方法時，咨詢人員的差旅費、工作函電費、資料費，以及試驗和檢驗費、交通和住宿費等均由業主另行支付。

這種方法主要適用于臨時性、短期咨詢業務活動，或者不宜按建設投資百分比等方法計算咨詢費的情形。

（三）按服務內容計費

這種方法是指在明確咨詢工作內容的基礎上，業主與工程咨詢公司協商一致確定的固定咨詢費，或工程咨詢公司在投標時以固定價形式進行報價而形成的咨詢合同價格。當實際咨詢工作量有所增減時，一般也不調整咨詢費。