1、軍事法院管轄的案件
現役軍人（含在編職工）和非軍人共同犯罪的，分別由軍事法院和地方法院或者其他專門人民法院管轄。但涉及國家軍事秘密的，全案由軍事法院管轄。對于下列案件，由地方人民法院或者軍事法院以外的其他專門法院管轄：
（1）非軍人、隨軍家屬在部隊營區內犯罪的；
（2）軍人在辦理退役手續后犯罪的； 來源：www.examda.com
（3）現役軍人入伍前犯罪的（需與服役期內犯罪一并審判的除外）；
（4）退役軍人在服役期內犯罪的（犯軍人違反職責罪的除外）。
現在軍民搞共建，可是審判分開算，只要不是穿軍裝，一律就歸地方辦，軍事秘密不要沾，粘上就歸軍隊管，鐵路法院管自己，有點爭議地方判。
2、鐵路運輸法院管轄的案件
鐵路運輸法院管轄的案件是鐵路系統公安機關負責偵破的刑事案件。主要包括：
（1）危害和破壞鐵路運輸和生產的案件；
（2）破壞鐵路交通設施的案件；
（3）火車上發生的犯罪案件；
（4）違反鐵路運輸法規、制度造成重大事故或嚴重后果的案件。
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