1.權證的本質是買入式期權，股指期貨則是基于股票指數的期貨產品，因此，二者的收益結構不同。
2.股指期貨與權證均有杠桿作用，但二者運用的原理不同。權證從定價上來體現杠桿作用，股指期貨則是從保證金交易制度上來體現這一點。
3.股指期貨交易具有賣空功能，而A股市場中目前推出的權證無法在真正意義上進行做空交易，只有創新試點類券商能夠進行權證創設，但也不是所有的權證都能夠被創設。
4.目前的權證到期時均為實物交割，涉及行權；而股指期貨到期時均為現金交割，更為靈活方便。
二、股指期貨與ETF之間的區別
ETF是開放型指數基金，它是以跟蹤指數投資為主的一種開放式基金，因為買賣的對象同樣是指數，因而與股指期貨存在一定的共同點。然而，二者之間也存在著很大差別，屬于完全不同的兩類投資工具。
1.ETF沒有保證金制度，不存在杠桿效應，因此不存在收益和風險的放大效應。
2.ETF的套利機制發生在一級市場和二級市場之間。一方面，在操作上，要實現用一攬子股票與ETF之間的套利比較繁瑣，而且要求很高；另一方面，在資金上，一級市場申購ETF所需的資金最低要100多萬元，與股指期貨的保證金制度相比，對資金的要求高得多。
不過，雖然股指期貨與ETF之間有很大的差別，但由于同樣具有投資指數的特點，使在股指期貨與ETF之間進行相關操作成為可能，特別是利用股指期貨對ETF的套期保值和相關的套利操作，將使投資者的投資更加安全。
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